FAQ – Le Gabarit Régional et la transmission des données

Une question sur le Gabarit standard et la transmission des données ?

Vous trouverez ici les réponses aux questions fréquentes liées à l’utilisation du Format Standard pour la transmission des Données.

Cette page est régulièrement alimentée et mise à jour à partir des questions qui nous sont posées
(dernière mise à jour : octobre 2025).

L’Observatoire Régional de la Biodivesité et sa plateforme « Biodiv’Aura » reposent sur une démarche collaborative. Ces outils ont pour vocation de rendre disponibles au maximum de personnes l’ensemble des données de biodiversité possible, gratuitement, en ligne. 

Afin de permettre une meilleure prise en compte des connaissances existantes et de la biodiversité, il est possible à toute personne produisant des données d’observation faune, flore, ou fonge, de transmettre ses données afin de les rendre librement accessibles sur nos outils. Cette contribution est une démarche volontaire pour les contributeurs privés, et permet aux acteurs publics de répondre à leurs objectifs de libre accès de leurs données. 

Toute donnée rattachée à une espèce du référentiel taxonomique taxref peut être prise en compte : faune, flore, champignons, algues, sangsues, mille-pattes, etc.

Si vous souhaitez alimenter la base de données régionale de l’Observatoire Régional de la Biodiversité (SINP), vous pouvez nous transmettre les données que vous produisez sur la biodiversité du territoire. Celles-ci seront prises en charge par le ou les pôles thématiques concernés (Flore-habitats-fonge, Invertébrés, ou Vertébrés) pour être intégrées et validées. Elles deviendront ainsi accessibles pour tous, en ligne, sur notre plateforme Biodiv’Aura.

Pour transmettre vos données, vous pouvez nous les communiquer via le tableur « gabarit standard de données », ou via tout autre format de fichier dès lors qu’il comprend toutes les informations obligatoires du gabarit standard. Des transmissions automatiques sont également possibles pour les producteurs de données « Faune » travaillant sous GeoNature.

Une fois votre fichier préparé, vous pourrez nous le transmettre via le formulaire dédié sur la page « Transmettre ses données ». 

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Le gabarit standard de données est un fichier tableur (.xlsx) pré-formaté pour faciliter la transmission des données à la base de données régionale. Il comprend tous les champs standards prévus pour les données d’occurrences de taxons (observations naturalistes) dans le SINP. 

Ce fichier tableur est prévu pour permettre à chacun de transmettre l’ensemble de ses données les plus complètes et précises, quel que soit son domaine de prédilection (faune, flore, fonge…). Chaque champs y est décrit et une ligne d’exemple est donnée pour faciliter sa prise en main. 

Le fichier s’articule en 3 onglets, pour permettre la transmission des données en elles-mêmes, mais également les métadonnées associées permettant de décrire le contexte dans lequel les données ont été produites (cadre d’acquisition) et comment elles ont été produites ou regroupées (jeu de données). 

Ce gabarit est adapté aux pratiques régionales mais s’appuie intégralement sur les format standard national du SINP. 

Vous pouvez apporter quelques modifications au gabarit standard de données

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